درمانگاه مشاوره عفونی بیمارستان فارابی یکی از درمانگاه های زیر مجموعه مشاوره قبل از عمل این بیمارستان است. بیماران کاندید جراحی چشم که مشکوک به مشکلات عفونی و مواردی مانند آنفلوانزا، کرونا یا موارد عفونی مشابه هستند پیش از جراحی به درمانگاه مشاوره عفونی ارجاع می شوند. این درمانگاه در محوطه بیمارستان فارابی، روبروی ورودی درمانگاه مشاوره قبل از عمل و جنب نوبت دهی پذیرش واقع شده است و متخصص عفونی بیمارستان، روزهای یکشنبه و چهارشنبه در نوبت های صبح و عصر به بیماران مورد نظر مشاوره می دهد.